Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSG1Q02413 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSG1Q02413 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms