Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XPCQ01831 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XPCQ01831 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
XPCQ01831 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XPCQ01831 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XPCQ01831 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XPCQ01831 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms