Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXOSC10Q01780 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXOSC10Q01780 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms