Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM3AP98173 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms