Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNA1P78396 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNA1P78396 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms