Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA6P60900 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA6P60900 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms