Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms