Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2BFSP57053 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms