Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARSP54136 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RARSP54136 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARSP54136 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARSP54136 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARSP54136 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARSP54136 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARSP54136 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RARSP54136 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RARSP54136 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RARSP54136 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RARSP54136 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms