Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP2S1P53680 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AP2S1P53680 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms