Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOSBP53539 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOSBP53539 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOSBP53539 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOSBP53539 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOSBP53539 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOSBP53539 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms