Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX2-5P52952 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX2-5P52952 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms