Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP98P52948 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP98P52948 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP98P52948 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP98P52948 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP98P52948 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms