Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RORCP51449 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RORCP51449 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RORCP51449 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RORCP51449 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RORCP51449 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RORCP51449 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RORCP51449 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RORCP51449 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RORCP51449 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RORCP51449 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RORCP51449 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms