Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNTAP49354 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTAP49354 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FNTAP49354 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FNTAP49354 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms