Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL35P42766 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPL35P42766 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms