Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms