Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C19P33261 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP2C19P33261 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms