Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID4AP29374 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms