Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms