Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMLP26374 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMLP26374 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMLP26374 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMLP26374 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms