Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATF4P18848 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATF4P18848 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATF4P18848 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATF4P18848 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATF4P18848 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATF4P18848 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms