Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPI1P17947 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPI1P17947 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPI1P17947 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms