Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
IFITM1P13164 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms