Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PF4V1P10720 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms