Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HKR1P10072 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HKR1P10072 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HKR1P10072 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms