Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRAPPC2P0DI81 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms