Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTA3P0C7M3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms