Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CXCL1P09341 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CXCL1P09341 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL1P09341 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL1P09341 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms