Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB5P09067 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXB5P09067 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms