Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ABCB1P08183 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ABCB1P08183 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms