Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-5P01602 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms