Protein–RNA interactions for Protein: P01597

IGKV1-39, Immunoglobulin kappa variable 1-39, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-39P01597 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-39P01597 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms