Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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TOMM40O96008 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TOMM40O96008 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOMM40O96008 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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