Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LRATO95237 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LRATO95237 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRATO95237 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRATO95237 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRATO95237 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms