Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG12O94817 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms