Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SKAP2O75563 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms