Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms