Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DHX16O60231 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DHX16O60231 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DHX16O60231 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms