Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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HOXA3O43365 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA3O43365 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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