Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNB1O43157 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms