Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2AO14813 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms