Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGB1P1B2RPK0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGB1P1B2RPK0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms