Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00587B1AMM8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LINC00587B1AMM8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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