Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NOTOA8MTQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NOTOA8MTQ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms