Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACOD1A6NK06 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms