Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C5orf51A6NDU8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms