Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms