Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIPSLA2A3N6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms