Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F8A0AVK6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms